Development of computational tools to assist in the reconstruction of molecular networks
- Rui Carlos Vaqueiro de Castro Alves Doktorvater
- Francesc Solsona Tehàs Doktorvater
Universität der Verteidigung: Universitat de Lleida
Fecha de defensa: 28 von Januar von 2014
- A. Sorribas Tello Präsident
- Alexandra Sofia Trinidade Rodrigues Da Silva Moura Sekretär/in
- Miguel Vázquez García Vocal
Art: Dissertation
Zusammenfassung
L'objectiu d'aquesta tesi és desenvolupar i implementar un conjunt d'eines de mineria de dades per ajudar en la reconstrucció de circuits biològics a través de l'anàlisi i la integració de grans conjunts de dades biològiques. Aquests circuits són importants perquè regulen tots els processos que controlen la vida i la salut dels organismes. El treball principal de la tesis es centra en l'anàlisi de les dades bibliòmiques desenvolupant-se dues eines, Biblio-MetReS per la reconstrucció de xarxes de PPIs i la identificació dels processos en què intervenen aquestes xarxes, i CheNER per la identificació de noms de compostos químics. L'eina final desenvolupada es centra en la integració de mètodes per a l'anàlisi estructural i modelització de proteïnes amb mètodes d'acoblament per a la predicció de complexos físics de proteïna-proteïna.